Die Arbeitsgruppe für die Ethik in der Forschung und Medizin beobachtet und erarbeitet Standpunkte, Berichte und Beiträge zur aktuellen EU-Debatte und zur EU-Politik in den Bereichen Forschung, Innovation und Gesundheit. Sie verfolgt außerdem die Arbeit der European Group on Ethics (EGE). Präsident der Arbeitsgruppe ist der COMECE-Generalsekretär Manuel Enrique Barrios Prieto.

Seit 2017 ist die Arbeitsgruppe unter neuen Modalitäten tätig. Sie bringt zusammen juristische und wissenschaftliche Experten im Rahmen einer Ad-hoc-Komposition, je nach den behandelten Themen. Ihr Moderator, Prof. Antonio Autiero, wird von Verbindungsreferentin Friederike Ladenburger unterstützt, die in Zusammenarbeit mit den Experten der Bischofskonferenzen der Länder der Europäischen Union die Arbeitsgruppe animiert.